Фамилия Семинаев — это, скорее всего, не ошибка в написании, а редкая и показательная модель русского словообразования. Вместо привычного суффикса -ов здесь стоит суффикс -аев, который в русской ономастике встречается нечасто и указывает на то, что основа фамилии — не имя, а прозвище или прилагательное.

Разбираем по составу: корень «Семин-» и суффикс «-аев». Суффикс -аев обычно присоединяли к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или на -й, но здесь он стоит после твёрдого «н». Это наводит на мысль, что в основе лежало не имя Семён, а притяжательное прилагательное «семиный» — то есть «относящийся к Семе». Сема — это уменьшительная форма от Семён, но, что важнее, в некоторых говорах «сёма» или «сема» означало «семьянин», «домосед» или «хозяин». Есть и другая версия: в диалектах «семинать» значило «шептать» или «ворчать», так что прозвище Сёма мог получить человек неразговорчивый или, наоборот, постоянно бормочущий.

Фамилия Семинаев — явление не массовое. Она встречается в Поволжье и на Урале, где в XVII–XVIII веках активно шёл процесс закрепления прозвищ в фамилии. Если бы фамилия образовалась от имени Семён стандартным путём, мы бы получили Семёнов или Семин. А здесь суффикс -аев — как отпечаток живой устной речи: кто-то записал прозвище «Сёминай» (то есть «сын Сёмы») и не стал подгонять под литературную норму.

С точки зрения сословия, носители фамилии Семинаев — почти наверняка крестьяне или посадские люди. Дворянские фамилии с таким суффиксом — единичны (например, Рахманинов), а Семинаевых в родословных книгах нет. Это фамилия, которая рассказывает о конкретном человеке: предок был Сёмой — либо по имени, либо по характеру, либо по семейному положению. И суффикс сохранил именно тот, кто записывал фамилию, а не тот, кто её носил.