Фамилия Сеначин — классический пример русской фамилии, образованной от личного прозвища. В её основе лежит прозвище Сенача, а суффикс -ин указывает на принадлежность: Сеначин буквально значит «сын Сеначи», «тот, кто из рода Сеначи». Такая модель с суффиксом -ин типична для северных и центральных областей России, где она конкурировала с более распространённой на юге и востоке моделью на -ов/-ев.

С происхождением самого прозвища Сенача всё не так однозначно, и здесь есть несколько версий. Самая бытовая гипотеза отталкивается от слова «сени» — холодного нежилого помещения между крыльцом и жилой частью избы. Если следовать этой логике, Сеначей могли прозвать тихого, скромного человека, который как бы держался в тени, — или, наоборот, зодчего, мастера, который эти самые сени строил. Вторая версия уводит в книжную, церковнославянскую традицию, где «сень» означает «тень» или «покров». В библейских текстах сень — это ветхозаветный прообраз новозаветных событий: например, заклание пасхального агнца считалось сенью, то есть тенью, жертвы Христа. Иногда слово «сень» использовали и для обозначения глубокого мрака, как в выражении «сень смерти». Такое прозвище могло бы носить назидательный, религиозный оттенок.

Третья версия связывает Сеначу с крестильным именем Симеон. В переводе с древнееврейского оно значит «услышанный Богом в молитве». В русском просторечии имя Симеон давало множество уменьшительных форм, и одна из них — Сенача, от которой уже напрямую пошла фамилия Сеначин. Эта гипотеза выглядит правдоподобнее остальных: подавляющее большинство русских фамилий образовано именно от крестильных имён, а прозвища, восходящие к названиям частей избы, встречаются реже. К тому же цепочка «Симеон — Сенача — Сеначин» хорошо ложится в типовую словообразовательную модель.

Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно: фамилии в России формировались веками, и процесс этот шёл неравномерно в разных сословиях и регионах. Но в любом случае Сеначин — живой памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе отголосок либо старинного имени, либо забытого прозвища.