Фамилия Сеникиде — редкий образец фамилии, образованной по греческой модели. Её основа восходит к крестильному имени Сеника, которое в свою очередь является народной формой канонического имени Ксенофонт (от греческого «ксенос» — чужой, гость, и «фонэ» — голос, то есть «чужеземный голос»). В русской традиции имя Ксенофонт давали при крещении, но в быту оно сокращалось до Сеника или Сеня. Фамильный суффикс -иде указывает на происхождение от отца: в греческом языке окончание -идес (в русской передаче -иде) означает «сын такого-то». Таким образом, Сеникиде буквально значит «сын Сеники» (или «потомок Сеники»).

Такая словообразовательная модель нехарактерна для исконно русских фамилий, где преобладают суффиксы -ов/-ев, -ин или -ский. Фамилии на -иде встречаются в основном у греков Причерноморья, а также у тех, кто переселился в Россию из греческих колоний или с Балкан. Носитель фамилии Сеникиде, скорее всего, принадлежал к греческой диаспоре, которая веками жила на юге России — в Крыму, на Тамани, в Одессе или Мариуполе. Там греки сохраняли свои родовые имена даже после перехода на русский язык и православие.

Интересная деталь: имя Сеника в русском быту могло также быть уменьшительным от Семён (Симеон) или Серафим. Но в данном случае греческий суффикс -иде отсекает эту версию — он крепко привязан к греческой ономастике. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Сеникин или Сеников.

В дореволюционных документах фамилия могла писаться по-разному: Сеникиде, Сеникиди, а иногда и Сеникидес — в зависимости от того, как переписчик передавал греческое окончание. После революции написание часто унифицировали, отбрасывая конечное -с, но оставляя -де. Географически фамилия привязана к южным губерниям, где осели греческие колонисты, и до сих пор встречается в основном на Кубани и в Крыму.