Фамилия Сеняилов — редкая и неочевидная. Если отбросить суффикс -ов, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?»), остаётся основа Сеняил. В ней слышится что-то восточное или библейское, но на самом деле корни, скорее всего, чисто русские, просто сильно искажённые устной речью.

Вероятнее всего, Сеняилов — это вариант фамилии Сенявилов или Синявилов. В основе лежит прозвище Синявило. В русских говорах «синява» — синева, синяк, а также народное название некоторых растений с синими цветами (например, василька). Суффикс -ил(о) в прозвищах часто образовывал названия орудий или лиц по действию: «синявило» могли прозвать человека, который часто ставит синяки, или того, кто красит что-то в синий цвет, либо просто обладателя синюшного лица. Переход «Синявило» в «Сеняило» — типичная для русских говоров замена звука: «синя» под влиянием аканья (произношения «а» вместо «я») могло звучать как «сеня», а «ви» и вовсе стянулось в «и», дав форму «Сеняило».

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — связь с личным именем Сеня (уменьшительное от Семён или Арсений). В этом случае фамилия образована по редкой модели: Сеня + -ил- + -ов. Суффикс -ил- в отыменных фамилиях встречается нечасто (сравните: Михаил — Михаилов, но не «Михайлов»). Если бы фамилия пошла от Сени, мы бы ждали форму Сенин или Сеняков. Поэтому версия с прозвищем Синявило выглядит убедительнее.

Географически фамилия Сеняилов встречается точечно, в основном в центральных и южных областях России, где аканье и замена «я» на «е» особенно сильны. Это не дворянская фамилия — суффикс -ов указывает на крестьянское или мещанское происхождение: предка звали Синявило, а его потомки стали Сеняиловыми. Никаких известных исторических деятелей с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её редкий, локальный характер.