Фамилия Сепко — яркий пример того, как одна буква в суффиксе меняет географию и историю рода. В ней нет привычного для русских фамилий окончания -ов или -ин, зато есть типично украинский или белорусский суффикс -ко, который в XVI–XVII веках был одним из самых распространённых способов образования фамилий в этих землях. Суффикс -ко (уменьшительно-ласкательный или патронимический) присоединяли к основе, чтобы указать на принадлежность к роду или дать прозвище: Сепко — это буквально «маленький Сеп» или «сын Сепа».

Основа «Сеп» — сокращённая или диалектная форма от канонического имени Степан (греч. Στέφανος, «венок, корона»). В украинской и белорусской народной традиции имя Степан часто «ужимали» до Степ, Стець, Сень, а в некоторых говорах — до Сеп. Фамилия Сепко могла закрепиться за сыном Степана, которого в быту звали просто Сеп. Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным глаголом «сепать» (цеплять, задевать) или прозвищем неловкого человека, однако антропонимические словари (например, работы Ю. Редько) указывают именно на имя Степан как основной источник.

Географически фамилия Сепко плотно привязана к западу Украины — Волынь, Ровенская, Житомирская области, а также к югу Беларуси (Брестчина). В России эта фамилия встречается редко и, как правило, у потомков переселенцев из этих регионов. В польской ономастике встречается похожая форма Sępko (от sęp — «гриф, стервятник»), но это уже совсем другая история — в русско-украинской среде такое толкование маловероятно.

Интересная деталь: в метрических книгах XIX века фамилию могли записывать по-разному — Сепко, Сіпко, Сепка. Разнобой в написании («е» или «і») часто зависел от местного произношения и грамотности писаря. Это значит, что поиск предков по фамилии Сепко лучше начинать не с точного написания, а с фонетического звучания и привязки к конкретному селу.