Фамилия Сепин — одна из тех, где простота звучания обманчива. На первый взгляд она укладывается в стандартную модель русской фамилии на -ин, которая образуется от основ на -а/-я. Но здесь основа не женского рода, а мужского — прозвище Сепа или Сёпа. Вопрос в том, что это прозвище означало.

Самая вероятная версия отсылает к диалектному слову «сеп» или «сёп». В русских говорах так называли особый вид корзины для сена или зерна, плетёный заплечный кузов. Прозвище Сепа могли дать человеку, который плёл такие корзины, торговал ими или постоянно носил. Фамилия, таким образом, оказывается профессиональной: предок был корзинщиком или крестьянином, чья работа была неразрывно связана с этой утварью.

Вторая версия — прозвище от глагола «сепить» (хватать, цеплять). В этом случае Сепа — человек хваткий, цепкий, возможно, приставучий или скуповатый. Такие прозвища по характеру давали часто, и они легко закреплялись за родом.

Третий вариант, менее вероятный, но возможный в южных и западных регионах: связь с украинским или белорусским «сеп» — цеп (орудие для молотьбы). Тогда прозвище мог получить молотильщик. Однако для центральной России «сеп» в значении «корзина» — основание надёжнее.

Географически фамилия Сепин встречается не слишком широко, но заметна в Воронежской, Тамбовской и Рязанской областях — как раз в зоне бытования рязанских говоров, где слово «сеп» (корзина) было в ходу. Это косвенно подтверждает первую версию.

По словообразованию фамилия простая: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей сын?» — Сепин), то есть буквально «сын Сепы». Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Сéпин, хотя в разговорной речи нередко смещается на второй. Морфологически фамилия стоит в ряду с такими же прозвищными образованиями, как Тепин, Кепин, Репин — все они образованы от коротких прозвищ на -а.

Известных носителей с этой фамилией, вошедших в крупные энциклопедии или справочники, нет. Это типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия, которая не попала в дворянские родословные книги, но сохранилась в народной среде.