Фамилия Сергегия — редкая и необычная для русского уха. В отличие от большинства русских фамилий, она не заканчивается на -ов, -ин или -ский. Её основа — каноническое мужское имя Сергей (от латинского Servius, «слуга» или «служитель»), но суффикс -ия наводит на мысль о нерусском, скорее всего, южнославянском или западном происхождении.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. В русской традиции фамилии от имени Сергей образовывались через притяжательные суффиксы: Сергеев (чей? — сын Сергея), Сергеевский (с польским оттенком), Сергеичев (от уменьшительной формы). Окончание -ия характерно для фамилий греческого, румынского или молдавского ареала (ср. Аргирия, Кирия), а также для искусственных фамилий, которые давали в духовных училищах. В семинарской практике могли переделать фамилию ученика на латинский манер, добавив -ия, чтобы придать ей «учёное» звучание. Таким образом, Сергегия могла возникнуть как книжная или облагороженная форма от простого Сергеев.

Географически фамилия почти не встречается в центральной России. Если она и бытует, то, скорее всего, на юге (в Ростовской области, Краснодарском крае) или среди потомков переселенцев из Молдавии и Румынии, где -ия — распространённый фамильный суффикс. В молдавском языке, например, фамилии типа Sergiu (от имени) давали форму Sergiia через румынскую орфографию.

Версия о греческом корне тоже имеет право на жизнь: фамилия могла произойти от греческого имени Сергий (Σέργιος) с добавлением окончания -ия, что характерно для фамилий греков Причерноморья. Однако в греческой традиции такие фамилии чаще оканчиваются на -иу или -оглу, так что вариант с -ия — скорее исключение.

Таким образом, носитель фамилии Сергегия, вероятно, имеет предка, который либо получил фамилию в духовной среде (семинарист или священник), либо происходит из южнославянских или румынских земель. Основой в любом случае послужило имя Сергей, но не прямое, а через адаптацию в иной языковой среде.