Фамилия Сершун — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного русского суффикса -ов или -ин, что сразу указывает на её нетипичную модель образования. Скорее всего, перед нами не патроним (фамилия по отцу), а застывшее прозвище или имя, которое не переоформили под стандартную форму. По этой причине искать корень нужно не в суффиксе, а в основе «Серш-».

Самое правдоподобное объяснение — связь с украинским или белорусским словом «сершун» (или «сэршун»), которое означало «сварливый, ворчливый человек» либо «ершистый, задиристый». В говорах юго-запада России и на территории современной Украины так могли называть человека с неуживчивым характером, того, кто постоянно «серчает» или «сершится». Фамилия, образованная напрямую от такого прозвища, минуя суффиксацию, характерна для восточнославянской ономастики, но встречается реже, чем привычные модели.

Второй, менее вероятный вариант — искажение фамилии Сершун из немецкого или польского корня. В немецком есть фамилия Scherz (шутка) или Scharschun, но для прямого заимствования без адаптации нет убедительных лингвистических подтверждений. Также иногда фамилию связывают с диалектным словом «шершун» — так в некоторых областях называли шершня, крупную осу. В таком случае прозвище могли дать за назойливость, громкий голос или внешнее сходство. Однако переход «шершун» в «сершун» через аканье или замену шипящего на свистящий (соканье) возможен, но не является типичным для литературного языка.

Географически фамилия Сершун встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине, что подтверждает первую версию: регион, где прозвища нередко закреплялись без суффиксов. В дореволюционных метриках и переписях XIX века носители фамилии отмечены среди крестьян и мещан — сословий, где прозвища передавались по наследству в бытовой форме, без вмешательства канцелярий. Таким образом, предок человека с фамилией Сершун с большой вероятностью был человеком с непростым нравом, которого в окружении запомнили как «сершуна» — ворчуна или задиру.