Фамилия Сейдакова — женская форма мужской фамилии Сейдаков, которая образована от имени или прозвища Сейдак. В основе лежит тюркское имя Сейит (арабское سيد, «господин», «потомок пророка») с уменьшительным суффиксом -ак. То есть Сейдак — это «маленький сейид», «младший потомок пророка». Такая модель распространена у татар, башкир и других тюркских народов Поволжья и Урала, где имена с корнем «сей-» (Сейфулла, Сейдамет) нередко усекали и добавляли ласкательный аффикс.

Суффикс -ов в фамилии указывает на русскую адаптацию: так оформляли фамилии при крещении или при записи в метрические книги в XIX веке. В самой татарской среде фамилия могла бы звучать как Сейдаков или остаться без суффикса (Сейдак), но в русскоязычной среде добавили типичное окончание. Это нередкий случай, когда исходно тюркское имя получает славянский «паспорт» через суффикс принадлежности.

Географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану, Оренбургской области, а также к регионам, куда переселялись татары после падения Казанского ханства — например, к Нижегородской области и Удмуртии. Встречается и у казахов (вариант Сейдаков), но там она часто происходит от имени Сейдак без арабской этимологии — от слова «сейдак» как «охотник» или «стрелок» (от тюркского «сейдак» — колчан для стрел). Для русской фамилии Сейдакова первая версия (через сейида) более вероятна, так как она объясняет и уменьшительную форму, и распространение среди крещёных татар.

Двойная версия происхождения — не редкость для фамилий, звучащих одинаково в разных языковых средах. Если предки носительницы фамилии были татарами-мусульманами, основа — «потомок пророка»; если из крещёных татар — то же самое, но с христианским контекстом. А если фамилия встречается у казахов или киргизов, стоит проверить вариант со значением «стрелок» или «охотник». В любом случае, Сейдакова — фамилия, которая несёт в себе следы степной иерархии и арабского влияния на тюркский мир.