Фамилия Сейков — один из тех случаев, где за простой и ясной словообразовательной формой скрывается неочевидная основа. На первый взгляд, перед нами типичная патронимическая модель: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Сейков), то есть «сын Сейка». Вопрос в том, что или кто такой Сейко.

Самая распространённая версия связывает эту фамилию с крестильным именем Сей. Это краткая, народная форма канонического имени Сергей (от римского родового имени Sergius). В русской традиции имя Сергей давало множество уменьшительных вариантов: Серёжа, Сергун, Сергейка, а на юге и западе России — Сей. Сейко — это тот же корень, только с уменьшительно-ласкательным суффиксом -к(о), характерным для украинской и белорусской антропонимии. Таким образом, Сейков — это «внук или сын Сергея», причём фамилия явно сформировалась в западнорусских или малороссийских землях, где фамилии на -ко (Сейко, Бойко, Шевченко) были особенно частотны, а затем обрусела, получив стандартное русское окончание -ов.

Есть и вторая, менее очевидная, но вполне реальная гипотеза. В некоторых южнорусских говорах и украинском языке слово «сей» (сейко) могло быть указательным местоимением («этот», «сей»). В быту такое прозвище могли дать человеку, который постоянно вставлял в речь это слово, или, например, младшему из двух братьев с одинаковыми именами (как «тот» и «этот»). Однако эта версия уступает первой по массовости: фамилии от местоимений в славянском мире редки, а вот производные от Сергея — одни из самых распространённых.

С точки зрения географии, фамилия Сейков сегодня встречается не повсеместно, а тяготеет к областям, граничащим с Украиной и Белоруссией: Брянская, Курская, Белгородская области, а также юг России. Это косвенно подтверждает её происхождение от южнорусского варианта имени Сергей. В дореволюционных ревизских сказках Сейковы могли быть как крестьянами, так и казаками — сословная принадлежность по одной фамилии не определяется, но суффикс -ов указывает на то, что фамилия закрепилась в среде, где уже была принята общерусская модель на -ов, а не на -енко или -ук.

Таким образом, носитель фамилии Сейков с высокой долей вероятности ведёт свой род от человека по имени Сейко, а тот, в свою очередь, от Сергея. Это фамилия, которая чётко вписана в восточнославянскую ономастику, но с ярко выраженным региональным колоритом — она звучит как «обрусевшая украинская» или «южнорусская», что и составляет её уникальность.