Фамилия Шаченко образована по типичной восточнославянской модели с суффиксом -енко, который в украинской ономастике указывает на «сына» или «потомка» человека, названного в основе. Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине и южным регионам России, где этот патронимический формант особенно распространён. Основа — Шач(а) — может происходить от разных корней, и здесь есть простор для версий.

Самое прямое объяснение: Шаченко — от прозвища Шак или Шачо, связанного с диалектным украинским глаголом «шакати» (ср. «шакати зубами» — стучать, клацать) или «шачити» (кричать, шуметь). Такое прозвище могли дать человеку с громким голосом, резким в движениях или чем-то напоминавшим шакала (через тюркское заимствование). Однако вторая версия выглядит надёжнее: Шаченко — это вариант фамилии Саченко, где начальное «с» перешло в «ш» под влиянием акающих говоров или просто из-за народной этимологии. Саченко, в свою очередь, происходит от имени Сава (Савва) или от прозвища Сак (сак — мешок, либо орудие ловли рыбы). В пользу этой версии говорит то, что в исторических документах XVII–XVIII веков на Полтавщине и Черниговщине встречаются параллельные написания — Саченко и Шаченко, что указывает на фонетическое колебание.

Есть и третий, менее вероятный вариант: от тюркского имени Шах (шах — владыка, правитель) через форму Шач. Но для украинской среды такая основа нетипична, а фамилия не фиксируется в казацких реестрах с высокой частотой, чтобы говорить о знатном происхождении. Скорее всего, предки носителя фамилии Шаченко были крестьянами или мелкими ремесленниками, получившими фамилию по отцу — Шаку или Савве.

Словообразовательная модель проста: суффикс -енко присоединился к основе Шач-, которая могла быть как полным именем (Шачо — уменьшительное от Шак), так и усечённой формой от Савва. В любом случае, фамилия Шаченко — типичный украинский патроним, распространённый в зоне влияния киевских и полтавских говоров. Встречается она и в Беларуси, но реже — там чаще пишут Шачонок.