Фамилия Шагабеев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Шагабеев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Шагабеев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Шагабеев образована от мусульманского имени Шагабей, которое представляет собой диалектный вариант имени Шагабай. Предположительно это имя восходит к двум тюркским основам: «шага» или «чага», что значит «ребёнок», и «бай» - «князь, повелитель, начальник, руководитель, глава, хозяин, господин». Изначально слово «бай» употреблялось как военный термин, но с течением времени оно стало активно использоваться в качестве именно основы при образовании составных тюркских имен. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Шагабеев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Шагабеев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.