Фамилия Шагабаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Шагабаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Шагабаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Шагабаев образована от имени Шагабай, которое состоит из двух элементов: казахского «шага» - «ребенок» и общетюркского «бай» - «богатый, господин». Давая такое имя своему ребенку, родители надеялись, что в будущем он станет богатым, знатным человеком. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Шагабаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Шагабаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.