Фамилия Шагабудинов образована от фонетического варианта фамилии Шагабутдинов, которая образована от мусульманского имени Шагабутдин. Это имя представляет собой диалектный вариант арабского имени Сахабетдин. На русский язык оно переводится как «верующие» или «те, которые идут по пути религии». Возможно, нарекая своего ребенка таким именем, родители желали ему стать достойным мусульманином. Таким образом, потомок человека, которого звали Шагабутдин, со временем получил фамилию Шагабудинов.