Фамилия Шагабуддинов — одна из тех, где исходное имя-основа почти полностью скрыта за русским суффиксом, но при этом сохраняет прозрачную восточную этимологию. Разбираем её с конца: суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель («чей?» — сын Шагабуддина). Сама же основа восходит к арабскому составному имени Шагабуддин (или Шагаб ад-Дин), что в переводе означает «юность веры» или «молодость религии». Первая часть — «шагаб» (араб. شباب — молодость, юность), вторая — «дин» (вера, религия). Это типичное теофорное имя, популярное в мусульманской среде, особенно у народов, испытавших влияние ислама: татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии.

Интересна необычная начальная буква «Ш» в русской записи. В арабском корне первый звук — «ш» (ش), но в тюркских языках, через которые имя чаще всего попадало в русские документы, он мог произноситься твёрже или переходить в «ч». Вариант «Шагабуддинов» — это, скорее всего, результат записи имени писцом на слух, с сохранением арабского произношения. Встречаются и однокоренные фамилии: Шагабутдинов (с «т» на стыке, что характерно для татарской огласовки), реже — Шагабутдинов, где «у» выпадает. Все они восходят к одному корню, и разница в написании — лишь местные диалектные или канцелярские особенности XIX — начала XX века.

По географии фамилия Шагабуддинов распространена в основном в Татарстане, Башкортостане, а также среди кавказских народов (особенно у лезгин и аварцев). Встречается и у казахов, но там чаще пишется как Шагабутдинов. Сословно носители фамилии — это потомки мулл, учителей медресе или просто людей, получивших имя в честь религиозного понятия; никакого указания на знатное происхождение фамилия не несёт. С точки зрения словообразования это классический пример, как арабское имя, пройдя через тюркскую и русскую языковые среды, превратилось в фамилию, сохранив и богословский смысл, и «русский» суффикс принадлежности.