Фамилия Шагабутдинова образована от мусульманского имени Шагабутдин, которое представляет собой диалектный вариант арабского имени Сахабетдин. Это имя переводится как «верующие» или «те, которые идут по пути религии». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Шагабутдиновых можно лишь на основании генеалогических исследований.