Фамилия Шакалините — звучит не по-русски, и это первое, что бросается в глаза. Её выдает суффикс. Формы на «-ите» (Šakalytė / Šakalīte) характерны для литовской женской фамилии. В Литве фамилии имеют четкий грамматический род: мужские заканчиваются на «-ас», «-ис», «-ус», а женские — на «-е», «-айте», «-уте». Окончание «-ините» (на письме часто передается как -inytė или -inė) указывает на то, что перед нами замужняя женщина или вдова, фамилия которой образована от мужской основы с помощью суффикса принадлежности. То есть Шакалините — это буквально «жена Шакалиса» или «из рода Шакалисов».

Основа фамилии — «Šakal-». В литовском языке слово šakalas означает «шакал». Однако, как и в русском, прямое зоологическое прозвище в Литве было не самым частым, но возможным. Шакалом могли назвать человека за определенные черты характера: хитрость, льстивость, крикливость или неразборчивость в средствах. В народной традиции Балтии образ шакала не был таким однозначно негативным, как, скажем, образ волка, — скорее, это прозвище для человека пронырливого и изворотливого.

Есть и вторая, более прозаичная версия происхождения. В литовских говорах слово šakalas могло обозначать не только животное, но и «сук», «развилину», «ветку» (от šaka — ветвь). В таком случае прозвище Шакалас мог получить человек, живший у развилки дорог, на перекрестке, или же имевший какую-то физическую особенность (например, раздвоенный подбородок или кривые ноги, напоминающие сучья). Эта версия кажется даже более правдоподобной, поскольку прозвища по месту жительства и по внешнему виду встречаются гораздо чаще, чем прозвища по диким животным.

В русском контексте фамилия Шакалините — это, скорее всего, результат литуанизации или переселения. Она могла появиться у потомков литовцев, переехавших в Россию в XIX–XX веках, или у людей из смешанных семей, сохранивших девичью фамилию матери по литовскому обычаю. В современных российских базах данных эта фамилия встречается единично, что подтверждает её узкую региональную и этническую привязку. В самой Литве однокоренные фамилии (Шакалас, Шакалене, Шакалите) встречаются чаще, особенно в восточных и южных районах страны, где были сильны славянские влияния.