Фамилия Шакасимов — редкий случай, когда тюркская основа соединилась с русским патронимическим суффиксом, но при этом избежала самого распространённого форманта. Если обычная модель для таких фамилий — Шакасимов (суффикс -ов), то здесь мы видим -им, который встречается в русских фамилиях гораздо реже и чаще указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на согласный.

Основа «Шакасим» восходит к двум корням. Первый, «шака» — в тюркских языках может означать «ветвь», «ответвление», «род» или «колено» (например, у казахов «шака» — это отдельная ветвь рода). Второй, «сим» — вероятно, арабское «сим» (знак, метка, имя) или искажённое «исм» (имя). Однако гораздо правдоподобнее, что перед нами сложное имя-пожелание, распространённое у народов Кавказа и Поволжья: «Шакасим» могло означать «ветвь (потомок) Сима» (библейского сына Ноя) или «знатный отпрыск». В тюркской антропонимии такие составные имена с религиозным оттенком встречаются нередко, хотя «Шакасим» — вариант нечастый.

Географически фамилия тяготеет к ареалу расселения татар, башкир и народов Дагестана. Встречается она в Татарстане, Башкортостане и среди ногайцев. Судя по структуре, фамилия оформилась на рубеже XIX–XX веков, когда русская администрация фиксировала тюркские имена по принципу «отец + -ов/-ев/-ин». Но выбор суффикса -им (вместо -ов) — признак того, что в конкретном говоре или при записи фамилию воспринимали не как «сын Шакасима», а как прямое прозвище «Шакасим», к которому добавили притяжательный суффикс «-им» («чей?» — «Шакасимов»). Такая модель встречается у русских фамилий от прозвищ типа «Гаврила» — «Гаврилин», но для тюркской основы это редкость.

Предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками в одном из тюркоязычных регионов Российской империи. Социальный статус — податное сословие: государственные или удельные крестьяне, реже — мещане. Фамилия не указывает на дворянское происхождение, но говорит о том, что родоначальник носил не просто имя, а прозвище с чёткой смысловой нагрузкой — указанием на родовитость или происхождение от определённой ветви племени.

В написании фамилии возможны варианты: Шакасимов (через «о» в окончании, как в паспорте) и Шакасимин (если сохранилась более старая форма). Но в современной русской орфографии закрепился первый вариант, хотя этимологически -им здесь не окончание, а часть суффикса.