Фамилия Шахбеков образована от мужского тюркского имени Шахбек. Первая из них восходит к имени Шах, которое в переводе с персидского означает «хан, повелитель; владелец, хозяин». Таким образом, потомок человека, которого звали Шахбек, со временем получил фамилию Шахбеков.