Фамилия Шахоткина — женская форма фамилии Шахоткин. В основе почти наверняка лежит прозвище или мирское имя Шахотка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Шахотки». Такая модель типична для северных и центральных русских говоров, где -ин так же распространён, как -ов на юге.

Корень «шах-» сразу отсылает к двум версиям, и обе имеют право на существование. Первая — тюркская. Слово «шах» (персидское, через тюркские языки) означало «царь, владыка», но в русских говорах могло стать частью прозвища: Шахом в крестьянской среде могли назвать человека важного, гордого или, наоборот, иронично — незначительного, но воображалу. Уменьшительная форма Шахотка («маленький шах») снимает пафос, делая прозвище скорее бытовым, насмешливым.

Вторая версия — славянская, глагольная. В некоторых диалектах «шахтать» означало «шататься, болтаться без дела», а «шахотка» — «беспокойный, суетливый человек». Эта гипотеза выглядит даже правдоподобнее: фамилия могла закрепиться за непоседой или тем, кто часто менял место жительства. Связь с шахтой (рудником) маловероятна: профессиональные прозвища шахтёров обычно образовывались от слова «шахтёр», а не «шахотка».

Фамилия редкая, географически не привязана к одному региону. Встречается в разрозненных записях XIX–XX веков в Тверской, Смоленской и Псковской губерниях — как раз на стыке северных и центральных говоров, где активно использовали суффикс -ин. Сословно носители, скорее всего, были государственными крестьянами или мещанами: дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Однокоренные фамилии — Шахов, Шахин, Шахотский — разошлись по разным словообразовательным моделям. Шахоткина стоит особняком: редкий уменьшительный суффикс -отк- (как в «работка» или «охота») делает её непохожей на массовые варианты. Если ваш предок носил такую фамилию, он, вероятно, происходил из среды, где прозвища давали не по ремеслу, а по характеру или внешности — и не боялись иронии.