Фамилия Шаботкина — женская форма, мужской вариант — Шаботкин. В основе лежит прозвище или имя Шаботка. Слово «шабот» в русских говорах означало тяжёлую деревянную или чугунную подставку, наковальню для ручной ковки. Кузнечное ремесло дало много фамилий, но здесь есть нюанс: суффикс -к- указывает, что исходное слово — не прямое название инструмента, а уменьшительное или уничижительное. Шаботкой могли прозвать невысокого коренастого человека, либо того, кто работал с таким инструментом — молотобойца или подмастерья кузнеца.

Слово «шабот» пришло в русский язык из немецкого (Schaft — стержень, ствол) или французского (chabot — подставка), и в ремесленной среде закрепилось именно в значении «наковальня». Фамилия Шаботкин могла возникнуть в среде мастеровых людей, особенно в центральных губерниях России, где кузнечный промысел был развит повсеместно. Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в Поволжье и на Урале — регионах, куда в XVIII–XIX веках переселялись ремесленники и заводские рабочие.

Менее вероятная версия — связь с диалектным глаголом «шаботать» (стучать, греметь, болтать). В этом случае прозвище Шаботка могли дать шумному, суетливому человеку. Но кузнечная этимология выглядит убедительнее: она опирается на реальное профессиональное слово, а не на редкий глагол.

По модели образования фамилия Шаботкин — типичная отпрозвищная фамилия на -ин. Она означает «сын Шаботки» или «принадлежащий Шаботке». В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от названий профессий (Кузнецов, Столяров), суффикс -ин в данном случае подчёркивает личное прозвище, а не сословную принадлежность. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был, скорее всего, не закрепощённым крестьянином, а свободным ремесленником или посадским человеком, у которого было своё прозвище, закрепившееся за потомками.