Фамилия Шаботина — женская форма от Шаботин, и её разбор стоит начать с суффикса. Типичный русский суффикс -ин указывает на принадлежность: Шаботин буквально значит «сын Шаботы» или «человек из семьи Шаботы». Основа здесь — прозвище Шабота, которое и ложится в корень фамилии.

Само прозвище Шабота, скорее всего, восходит к диалектному слову «шабот» — так в южнорусских и украинских говорах называли неуклюжего, нерасторопного человека, либо, в ином значении, большую деревянную колотушку или часть кузнечного молота. Если предок получил такое прозвище за медлительность или грузность, это типичная для русских фамилий модель — от характеристики внешности или поведения. Есть и другая, менее вероятная версия: связь с фамилией Шабанов (от тюркского «шабан» — сытый, богатый), но здесь фонетика расходится: «а» под ударением и твёрдое «т» вместо «н» делают эту гипотезу натянутой.

Географически фамилия Шаботин (и Шаботина) встречается редко, её очаги — преимущественно юг России и восток Украины, где диалектное слово «шабот» было в ходу. В дореволюционных переписях такие фамилии чаще фиксировались среди крестьян и мещан, а не дворянства — прозвище слишком бытовое, чтобы стать родовым для знати. Интересно, что в некоторых говорах «шабота» могло означать и болтуна, пустомелю, что добавляет ещё один оттенок к характеру возможного предка.

Словообразовательная модель проста: усечение суффикса -ин в женском варианте не происходит, поэтому Шаботина — стандартная матронимическая или родовая форма, образованная по тому же принципу, что и Марьина, Ильина. Редкость фамилии объясняется не только узкой диалектной базой, но и тем, что прозвище Шабота не стало популярным личным именем — в отличие, скажем, от Шабан или Шабаш. Если вы носите эту фамилию, ваши предки почти наверняка жили в сельской местности чернозёмной полосы, и их прозвище родилось из живого говора, а не из книжного языка.