Фамилия Шакимбаева — яркий пример антропонима, сформированного по тюркской модели. Её основа восходит к мужскому личному имени Шакимбай. Это составное имя: первая часть «Шаким» (или «Шаки») — вероятно, фонетический вариант арабского имени Шакир, которое означает «благодарный», «признательный». Вторая часть — «бай», традиционный для тюркских народов титул, означающий «господин», «богатый человек», «хозяин». Таким образом, имя Шакимбай можно истолковать как «благодарный господин» или «богатый благодарностью».

Фамилия Шакимбаева заканчивается на суффикс -ева, что указывает на её происхождение от отца (патроним). В русской традиции оформления тюркских фамилий окончание -ев (или -ов) добавлялось к основе мужского имени для обозначения принадлежности: «сын Шакимбая» — Шакимбаев. Женская форма Шакимбаева, соответственно, означает «дочь или жена Шакимбаева». Суффикс -ев, а не -ов, подсказывает, что основа имени оканчивалась на мягкий согласный или гласный — в данном случае на -й.

Географически фамилия наиболее характерна для народов Средней Азии и Казахстана. Модель «имя + бай» — одна из самых распространённых в казахском, киргизском, узбекском и каракалпакском именословах. Носительница фамилии Шакимбаева с высокой вероятностью имеет корни в одном из этих регионов. В дореволюционный период такие фамилии часто закреплялись за представителями зажиточных слоёв или родоплеменной знати, но со временем потеряли сословную окраску и стали массовыми.

Отличительная черта этой фамилии — сохранение полной, нередуцированной формы имени-основы. В отличие от многих русифицированных тюркских фамилий, где «бай» мог превратиться в «Баев» или вовсе отпасть, здесь он остался в составе, что делает этимологию прозрачной. Если сравнивать с однокоренными фамилиями (например, Шакиров), то Шакимбаева стоит в ряду двукоренных имён, где второй корень указывает на социальный статус предка, а не на его личное качество.