Фамилия Шакирбаев образована по тюркской модели, где к основе прибавляется компонент «бай» (в переводе с тюркских языков — «богач, господин, хозяин»). Этот элемент был широко распространен в Казахстане, Средней Азии, среди татар и башкир как часть составных имен и прозвищ, подчеркивающая статус или пожелание благополучия. Первая часть — Шакир — восходит к арабскому имени Шакир (Шакир), которое означает «благодарный» или «тот, кто благодарит Бога». Имя популярно в исламской традиции, встречается у многих тюркских народов.

Таким образом, Шакирбаев — это фамилия, возникшая от личного имени Шакирбай (Шакир + бай). В прошлом ее носителем мог быть человек, которого нарекли «благодарным господином» или «благодарным богачом». Имена с компонентом «бай» часто давали с пожеланием богатства и удачи, но со временем они превратились в наследственные фамилии.

Словообразовательный суффикс -ев указывает на русское оформление фамилии, характерное для многих тюркских родов, попавших в орбиту Российской империи. В оригинале, без русификации, фамилия звучала бы как Шакирбай или Шакирбайулы (в казахской патронимической системе). Географически фамилия чаще всего встречается среди казахов, а также у башкир и татар. Встречаются варианты написания: Шакирбаев, Шакирбай, реже — Шакирбаев.

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную форму с прозрачной внутренней формой: в отличие от многих русифицированных фамилий на -ов, здесь легко читается исходное имя-пожелание. Если предки носили такую фамилию, они, скорее всего, были из среды степной аристократии или зажиточных скотоводов, где имя «бай» было знаком уважения.