Фамилия Шакирбая звучит не по-русски, и это подсказка: перед нами яркий пример фамилии, сформировавшейся в среде тюркских или кавказских народов, где её носители и сегодня встречаются чаще всего. В основе лежит мужское имя Шакир, которое восходит к арабскому «шакир» — «благодарный», «признательный». В исламской традиции это одно из эпитетов, прославляющих человека, и имя было широко распространено у многих мусульманских народов бывшего СССР.

Ключевая особенность фамилии — её окончание «-бая». В тюркских языках «бай» означает «господин», «богач», «хозяин», а в прошлом было и титулом, и частью составных имён (например, Турсунбай, Кутлубай). В фамилии Шакирбая суффикс «-а» на конце — это, скорее всего, русская адаптация тюркского притяжательного окончания или просто оформление по образцу русских фамилий на «-а» (типа Кузнеца, Скворца). Получается, что исходная форма — Шакирбай (имя-прозвище «благодарный господин»), которое в документах превратилось в Шакирбая.

Такая модель образования (личное имя + «бай» + русское окончание) типична для фамилий, возникших в XIX—XX веках у народов, вошедших в состав Российской империи, особенно в Средней Азии, Татарстане, Башкортостане и на Кавказе. В отличие от русских фамилий на «-ов» и «-ин», которые указывают на принадлежность отцу, Шакирбая прямо наследует личное имя предка, подчёркивая его социальный статус или уважительное обращение. Споров вокруг корня нет: арабское происхождение имени Шакир и тюркский компонент «бай» — факт, подтверждённый ономастическими справочниками. Встречаются варианты написания: Шакирбаев, Шакирбай, но форма Шакирбая — самая редкая и архаичная, сохранившая исходное звучание почти без изменений.