Фамилия Шакшов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного прозрачного корня вроде «кузнец» или «попов», и её носителям приходится разбираться в нескольких версиях.

Самый вероятный путь — от прозвища Шакша. В русских говорах Поволжья и Урала «шакша» — это мелкая лесная нечисть, леший или просто неопрятный, взлохмаченный человек. В словаре Владимира Даля зафиксировано слово «шакша» в значении «леший» в вятских говорах. Прозвище могли дать человеку с неопрятной внешностью, лохматыми волосами или угрюмым, диковатым нравом. Суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей?» — Шакшов, то есть сын или потомок Шакши.

Есть и другая, менее распространённая версия: от тюркского имени или прозвища Шакша. В тюркских языках (татарском, башкирском, чувашском) «шакша» может означать «пёстрый», «рябой», а также «череп» или «голова». В этом случае фамилия могла возникнуть у народов, контактировавших с русскими, а затем обрусела через суффикс -ов. На это указывает и география: фамилия Шакшов встречается в Татарстане, Башкирии, Оренбургской области — в зоне давнего русско-тюркского соседства.

Третья, совсем редкая гипотеза — от финно-угорского корня. В коми-зырянском языке «шакш» означает «иней», «изморозь». Прозвище могли дать человеку с седыми волосами или холодным, отстранённым характером. Однако эта версия слабее двух предыдущих, так как не подтверждается массовым бытованием фамилии в финно-угорских регионах.

Сословная принадлежность предков Шакшовых, скорее всего, крестьянская или мещанская. Фамилия не дворянская и не купеческая — в родословных книгах она не отмечена. Встречаемость фамилии крайне низкая: по данным современных справочников, на всю Россию приходится не более нескольких сотен носителей, большинство — в Приволжском и Уральском федеральных округах.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что Шакшов — это потомок прозвища, данного по внешности или характеру, с возможным тюркским следом. Точный ответ дала бы только генеалогическая работа с конкретной семьёй.