Фамилия Шалонская звучит по-дворянски, но её корни, скорее всего, прозаичнее и древнее. Она образована по типичной для польской и западнорусской шляхты модели: основа плюс суффикс -ск- и окончание -ая (или -ий в мужском варианте Шалонский). Такие фамилии указывали на владение землёй или происхождение из конкретного места. В данном случае это почти наверняка топонимическая фамилия, связанная с названием населённого пункта — Шалоны, Шалонь или похожего. Такие названия встречаются в Беларуси и на западе России, например, деревня Шалонь в Псковской области.

Но есть и другая, более редкая версия. Основа «шалон» может восходить к французскому городу Шалон (Châlons). В XVIII–XIX веках в Россию приезжали французские мастера, гувернёры и офицеры, и фамилия Шалонский могла закрепиться за выходцем оттуда или за русским, побывавшим во Франции. Однако эта версия менее вероятна: для иностранцев в России чаще использовали фамилии на -ов/-ев (Шалонов).

Географически фамилия Шалонская — редкая. Её носительницы в основном встречаются на северо-западе России, в бывших псковских и новгородских землях, а также среди потомков польской шляхты, переселившихся в центральные губернии. Суффикс -ск- в женской форме -ская однозначно указывает, что фамилия сформировалась в среде, где было принято дворянское или шляхетское самоназвание — то есть предки могли быть мелкими землевладельцами или служилыми людьми, получившими фамилию по названию своего поместья.

Итак, самое правдоподобное объяснение: предок Шалонских владел или жил в деревне с названием вроде Шалоны. Со временем прозвище «Шалонский» закрепилось за его потомками, а женская форма — за дочерьми и жёнами. Фамилия не получила широкого распространения, что делает её своеобразным маркером узкого локального происхождения.