Фамилия Шалягова — женская форма фамилии Шалягов. В основе её лежит прозвище или мирское имя Шаляга. Слово «шаляга» в русских говорах имеет несколько значений, и чтобы понять, кем был предок, нужно разобраться в географии и контексте.

Самое вероятное объяснение: «шаляга» — это диалектное название бродяги, шатуна, человека, который «шляется». В этом случае фамилия образована от прозвища, данного за непоседливый характер или образ жизни. В говорах Архангельской и Вологодской областей «шаляга» означала также «неряха» или «растрёпа», что тоже могло стать основой для прозвища.

Менее распространённая, но возможная версия связывает слово «шаляга» с рыболовным термином. В некоторых северных диалектах так называли небольшую рыболовную снасть или сеть. Тогда Шаляговым мог быть рыбак, либо человек, делавший такие снасти. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ или названий профессий: Шаляга + -ов = «сын или потомок Шаляги».

Фамилия редкая, её географическое ядро, скорее всего, находится на Русском Севере или в Поволжье, куда переселялись северяне. Встречается она и в среде донских казаков, где также бытовало слово «шаляга» в значении «гуляка». Учитывая, что фамилия не дворянская и не церковная, её носители, вероятнее всего, происходили из крестьян или посадских людей, получивших прозвище по поведению или роду занятий.