Фамилия Шалякина — женская форма фамилии Шалякин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Шаляка, которое, скорее всего, восходит к глаголу «шалять» — в старых русских говорах это означало «бездельничать», «баловаться», «проказничать». Соответственно, Шалякой в XV–XVII веках могли назвать озорника, повесу или человека, который уклонялся от работы. В словаре В. И. Даля зафиксировано слово «шаляга» в значении «лентяй, шатун», что подтверждает эту версию.

Менее вероятно, но возможно, что корень связан с диалектным «шаль» — обморок, дурь или болезнь. Тогда Шалякой могли прозвать человека со странностями, «блажного». Однако глагольная основа «шалять» встречается шире и даёт более прямую мотивацию для прозвища.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шалякин буквально означает «сын Шаляки» или «человек из рода Шаляки». Такая модель образования типична для русских фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от имён на твёрдый согласный, -ин крепился к основам на -а/-я, что как раз и даёт Шаляка → Шалякин.

Географически фамилия Шалякина встречается в центральных и северных областях России — в Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях. В этих местах глагол «шалять» был особенно употребителен. По сословию носители, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, реже — мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Шалягин, Шаляев, Шалунов, — то все они имеют одинаковую смысловую окраску: указывают на поведенческую характеристику предка. Но Шалякин выделяется именно суффиксом -ин, который в бытовой речи звучал как указание на конкретного человека: «чей ты? — Шалякин», то есть из семьи того самого Шаляки.