Фамилия Шалютина — женская форма от мужской Шалютин. Её основа, скорее всего, восходит к прозвищу или нецерковному имени Шалюта. Это слово — производное от глагола «шалить» (проказничать, баловаться). В русских говорах «шалюта» могло означать озорника, непоседу или даже плута. Суффикс -ут- в таких прозвищах (ср. Бегута, Игута) придаёт оттенок действия или свойства: Шалюта — тот, кто постоянно шалит.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе на -а добавляется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность «чей?» — Шалютин, то есть сын, потомок Шалюты. Встречаются и однокоренные фамилии: Шалимов, Шалаев, Шалобанов — все они так или иначе связаны с понятием шалости, проказ, хотя и образованы от разных диалектных форм.

С географией у фамилии Шалютин/Шалютина всё относительно прозрачно. По данным современных справочников, она встречается преимущественно в центральных и южных областях России, а также в Поволжье. В дореволюционных источниках носители фамилии фиксировались в основном среди крестьян и мещан. Например, в метрических книгах Тамбовской губернии XIX века попадаются Шалютины — это указывает на бытование фамилии в чернозёмной полосе, где оседлое сельское население часто получало прозвища по характеру.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда её пытаются связать с тюркским корнем «шал» (седой, пегий), но это маловероятно: суффикс -ут- нехарактерен для тюркских заимствований в русском языке, да и значение «седой» не даёт естественной модели для прозвища Шалюта. Поэтому версия от «шалить» остаётся основной и самой правдоподобной.