Фамилия Шамберекян — один из тех случаев, когда внешне славянское звучание обманчиво. Перед нами типичная армянская фамилия, образованная по патронимической модели с суффиксом -ян, который в армянском языке означает принадлежность или происхождение («из рода такого-то»). Основа фамилии — личное имя или прозвище Шамберек.

Корень фамилии, скорее всего, восходит к тюркским или персидским элементам, проникшим в армянскую ономастику через многовековые контакты народов Закавказья. Первая часть «шам» может быть связана с тюркским словом «шам» (свеча, светильник) или с арабским «шам» (Сирия, Дамаск). Вторая часть «берек» — почти наверняка тюркское «бек» (господин, князь, правитель). Таким образом, Шамберек могло быть составным именем или прозвищем, которое можно перевести как «светлый господин», «сияющий князь» или даже «дамасский бек» (указывая на географическое происхождение предка). Встречаются и более прозаичные версии: «шам» в диалектах могло означать и «обман», «плутовство», но для фамилии такая трактовка менее вероятна.

Модель образования фамилии через -ян (Шамберек + ян) указывает, что предок носителя фамилии был известен под именем или прозвищем Шамберек. Подобные сложные имена с компонентом «бек» были распространены в среде армян, живших в тесном соседстве с тюркскими народами (в Восточной Армении, Нагорном Карабахе, а также в армянских общинах Османской империи). Носитель такого имени мог быть из знатного рода, либо это было почетное прозвище, данное уважаемому человеку, торговцу или воину.

В русском языке фамилия Шамберекян обычно сохраняет ударение на последнем слоге, как в оригинале. Встречаются варианты написания через «а» (Шамберекян), что связано с особенностями передачи армянской фонетики кириллицей. Поскольку фамилия редкая и не имеет широкой географии за пределами армянской диаспоры, её носители — это потомки людей, носивших имя Шамберек, и фамилия четко указывает на армянские корни семьи.