Фамилия Шамгунов ведет свое начало от арабского мужского имени Шамгун. В переводе на русский язык оно означает «свеча, светильник». У этого имени есть диалектальные варианты – Шамун, Шамай. Вероятно, нарекая ребенка именем Шамгун, родители желали, чтобы душа их сына всегда стремилась к светлому началу, чтобы ее тепло согревало окружающих. Таким образом, потомок человека, которого звали Шамгун, со временем получил фамилию Шамгунов.