Фамилия Шамнаев — редкий случай, когда основа, скорее всего, не тюркская, а финно-угорская, и связана не с именем, а с прозвищем по месту жительства. Модель образования проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), а корень «Шамнай» — это исходное прозвище или имя.

Самый вероятный источник — марийское слово «шамнаш» (думать, размышлять) или его производные. В этом случае Шамнай — прозвище вдумчивого, рассудительного, возможно, неспешного человека. В марийской ономастике встречаются фамилии с похожей основой (Шамшурин, Шамов), и Шамнаев логично вписывается в этот ряд. Версия с тюркским корнем «шам» (свеча, огонь) или арабским «шам» (Сирия, Дамаск) выглядит натянутой: для таких основ типичны суффиксы -ов или -ин, а не -ев, и в Поволжье, где фамилия бытует, тюркский след слабее.

Географически Шамнаевы концентрируются в Марий Эл и соседних регионах — Татарстане, Кировской области. Это подтверждает финно-угорскую версию: фамилия оформилась в среде марийцев, которые в XIX веке массово получали фамилии по прозвищам. Сословно предки, скорее всего, были государственными крестьянами, а не дворянами или купцами: фамилия не фиксируется в родословных книгах и не имеет «дворянских» суффиксов вроде -ский.

Встречается вариант написания «Шамнаев» с ударением на второй слог (ШамнАев), что тоже типично для марийских фамилий, где ударение часто падает на корень, а не на суффикс. Если у вас сохранились семейные предания о происхождении из конкретной деревни, стоит проверить марийские списки населённых мест конца XIX века — там могли быть записаны однофамильцы.