Фамилия Шамшукаев — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не прозвище, а диалектное слово, почти забытое в литературном языке. Её ядро — «шамшук» или «шамшука». В южнорусских и украинских говорах так называли человека с большой нижней губой, которая оттопыривается или свисает. Слово того же корня, что и «шамкать» — говорить невнятно, мямлить, или «шамшура» — ротозей, разиня. Таким образом, первый Шамшукаев получил фамилию по заметной внешней черте или, реже, по манере речи.

Модель образования проста и прозрачна: прозвище Шамшука (или Шамшук) плюс типичный русский патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Шамшукаев). Окончание -ев, а не -ов, подсказывает, что основа оканчивалась на мягкий или шипящий согласный (шук/шукь). Встречаются параллельные варианты — Шамшуков, Шамшукин, — но Шамшукаев сохранил более архаичную форму прозвища с окончанием -а.

Географически фамилия тяготеет к югу России: Курская, Воронежская, Ростовская области, а также к украинскому приграничью. Там слово «шамшука» бытовало в живой речи ещё в XIX веке. В северных и центральных губерниях её почти не фиксируют — это дополнительный аргумент в пользу именно диалектного, а не книжного происхождения.

Сословная принадлежность по фамилии не определяется: Шамшукаевы встречались и среди крестьян, и среди мещан, и в казачьей среде. Прозвище не несло оскорбительного оттенка — в деревенской среде меткие уличные клички по внешности давали без злого умысла, и они легко становились фамилиями. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предок не был дворянином, иначе фамилия звучала бы иначе — скорее всего, с суффиксом -ский или вовсе другой основой.

С точки зрения словообразования, Шамшукаев — редкий пример фамилии, где сохранился нередуцированный диалектный корень. В отличие, скажем, от Шамшурина (от «шамшура» — шапка, колпак), здесь нет связи с головным убором. А в отличие от Шамшева (от тюркского имени Шамша) — нет и восточного следа. Это чисто русская, местная, «говорящая» фамилия, которая прямо указывает на то, как выглядел или говорил её первый носитель.