Фамилия Шаршаткина — женская форма фамилии Шаршаткин, и её разбор лучше начать не с корня, а с суффикса. Модель на -кин (-к + -ин) указывает на то, что основа — прозвище или имя, оканчивающееся на -ка: Шаршатка. Суффикс -ин в русских фамилиях традиционно означал принадлежность («чей сын?»), а вставка -к- здесь — не уменьшительная, а словообразовательная, характерная для северных и центральных говоров. То есть Шаршаткин — это «сын Шаршатки», а Шаршатка — прозвище человека.

Корень «шаршат-» вызывает несколько версий. Самая прямая и правдоподобная — от диалектного слова «шаршавый» (шершавый, шероховатый). В говорах Вологодской, Архангельской, Кировской областей «шаршавый» означало не только «неровный на ощупь», но и «грубый, неотёсанный» в характере. Прозвище Шаршатка могли дать человеку с жёсткими волосами, с грубой кожей или с резким, неуживчивым нравом. Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «шаршать» — шуршать, издавать глухой звук (например, при ходьбе в лаптях по сухой траве). В этом случае прозвище могло относиться к походке или манере одеваться.

Географически фамилия Шаршаткин редкая и локальная. Основные следы — в Нижегородской области и в Поволжье. Встречается в метрических книгах села Богородское (ныне Богородск) и окрестностей. Это указывает на то, что прозвище бытовало в среде крестьян-старообрядцев или государственных крестьян, где сохранялась архаичная лексика. Интересно, что в той же местности фиксируются однокоренные фамилии Шаршавин, Шаршаков — они образованы от того же корня, но по другим моделям. Шаршаткин среди них — самая редкая и самая «дробная» по суффиксу.

Сословно предки Шаршаткиных, скорее всего, были крестьянами. Фамилия не дворянская (отсутствует в родословных книгах), и не купеческая (нет фиксации в гильдиях). В XVIII–XIX веках такие фамилии на -кин часто появлялись в среде однодворцев и черносошных крестьян, где прозвища давали по внешности или повадкам. Если исходить из корня, то родоначальник — человек с заметной «шершавостью»: либо внешней, либо в поведении, что в деревенской среде не было редкостью.