Фамилия Шайдаков образована от прозвища Шайдак. Оно ведет свое начало от украинского диалектного нарицательного «шайда» со значением «часть ткацкого верста». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Шайдак относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть ткачом или мастером по изготовлению и ремонту ткацких станков. Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Шайдаков лежит мужское тюркское имя Шайди, которое в переводе с казахского означает «радость». Так и прозвище Шайдак закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шайдаков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шайдак, со временем получил фамилию Шайдаков.