Фамилия Шайгу — редкий случай в русском ономастиконе, когда носитель фамилии известен всей стране, а происхождение фамилии остаётся загадкой для большинства. Вопреки распространённому мнению, эта фамилия не русская и не славянская по корню. Её географическая привязка — Кавказ, точнее, Северо-Западный Кавказ, где проживают адыгские народы.

Разбираем словообразовательную модель. Фамилия Шайгу (в оригинальном произношении — Шъагу) состоит из двух частей: «шъа» и «гу». В адыгейском и кабардино-черкесском языках «гу» означает «сердце». Первая часть «шъа» восходит к слову «шъы» — «олень». Таким образом, буквальное значение фамилии — «оленье сердце» или «сердце оленя». Это не бытовое прозвище, а, скорее всего, родовое имя, восходящее к тотему или эпическому прозвищу. Олень в адыгской мифологии — символ благородства, скорости и чистоты, а сердце — вместилище духа и мужества. Сложносоставные фамилии такого типа характерны для адыгской антропонимии, где в основе лежит метафора или комплиментарное качество.

Ударение в русской передаче фамилии — на последний слог: Шайгу́. В оригинале, в адыгейском языке, ударение также падает на второй слог. Фамилия не изменяется по падежам: Шайгу (кто?), Шайгу (кого?), Шайгу (кому?). Это типичное поведение для фамилий, оканчивающихся на гласную, в русском языке.

Сословная принадлежность предков носителей фамилии Шайгу не зафиксирована в массовых источниках. Скорее всего, это была фамилия свободных общинников, воинов или княжеских дружинников, но не крепостных крестьян — в адыгском обществе институт крепостничества был слабо развит. Встречается фамилия в основном среди адыгейцев, шапсугов и кабардинцев. Наиболее известный носитель — Сергей Шойгу, чей отец Кужугет Сергеевич Шойгу был тувинцем, а мать Александра Яковлевна Шойгу — русской. Однако фамилия Шойгу — это русифицированная форма той же адыгской фамилии Шайгу, адаптированная под тувинское произношение. Таким образом, корни фамилии всё равно ведут на Кавказ, к адыгским народам.

В русском языке фамилия Шайгу не имеет однокоренных «родственников»: она стоит особняком, не образуя гнёзд с русскими фамилиями. Зато в адыгской среде есть варианты с тем же корнем «гу»: например, фамилия Гучепш (от «гу» — сердце и «чепш» — сталь, то есть «стальное сердце»). Это подтверждает, что модель «прилагательное + сердце» была продуктивной в адыгской антропонимии.