Фамилия Щипоникова — женская форма фамилии Щипоников, которая образована по русской патронимической модели с суффиксом -ов. В основе лежит прозвище или мирское имя Щипоник. Чтобы понять его происхождение, нужно разобрать слово по составу: корень «щип-» и суффикс «-ник». Первая часть явно отсылает к глаголу «щипать» — действию, которое в старину было связано с разными ремёслами: щипали лён, коноплю, перья, кору для лыка. Суффикс «-ник» в русских прозвищах часто указывал на человека по его занятию (ср. кожевник, плотник, сапожник). Таким образом, Щипоник — это, скорее всего, профессиональное прозвище: щипальщик, работник, который обрабатывал лён или коноплю, отделяя волокно от костры. Это довольно трудоёмкое и специфическое ремесло, распространённое в крестьянской среде северных и центральных губерний России, где выращивали лён.

Версия о связи с инструментом — щипцами или клещами (щипниками) — менее вероятна, но не исключена. В некоторых говорах «щипоником» могли называть кузнеца или мастера, работающего с металлом, который постоянно пользовался щипцами. Однако в этом случае фамилия была бы более редкой, так как кузнечные прозвища обычно имели другие модели (Кузнецов, Ковалёв).

География фамилии Щипоников и Щипоникова сегодня неширокая. Наибольшая концентрация носителей фиксируется в южных регионах России — в Волгоградской и Ростовской областях, а также на Кубани. Это может указывать на миграцию крестьян в XIX — начале XX века в ходе освоения южных земель. Встречается фамилия и на Украине, что логично, учитывая историческую связь территорий.

Словообразовательная модель с суффиксом «-ик» в основе (Щипоник → Щипоников) характерна для фамилий, возникших от прозвищ на -ик, -ник. Такие фамилии не княжеские и не боярские — они относятся к позднему пласту русских фамилий, которые окончательно закрепились в крестьянской среде после отмены крепостного права в 1861 году. Так что предки носителей фамилии Щипоникова, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, занятыми в льноводстве или других ремёслах, связанных со щипанием.