Фамилия Шеботнева — женская форма фамилии Шеботнев. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или шипящий. В данном случае основа — Шеботень.

Ключ к пониманию фамилии — в основе «шебот». В русских говорах слово «шебот» (или «шеботень») означало хлопотливого, суетливого человека, непоседу. В словаре Владимира Даля «шеботать» — хлопотать, суетиться, беспокоиться. Таким образом, прозвище Шеботень получил кто-то из предков за живой, беспокойный нрав, за склонность к суете и хлопотам. Это так называемое «характерологическое» прозвище — один из самых распространённых типов в русской антропонимии.

Модель образования проста: прозвище Шеботень → отчество (или фамилия отца) Шеботнев → женская форма Шеботнева. Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Шеботнев, то есть сын или потомок Шеботня. Фамилия эта относительно редкая, что говорит о её локальном бытовании. Вероятнее всего, она закрепилась в какой-то одной местности, где слово «шеботать» было в ходу, и не получила широкого распространения по стране.

Иногда основу «шебот» связывают с тюркскими языками, где есть корни со значением «удар», «бить», но для русского бытового прозвища версия с «хлопотливым человеком» гораздо правдоподобнее: она объясняет и форму, и смысл, и характерный для народной речи суффикс -ень. Искусственно притягивать тюркскую этимологию здесь нет нужды.

Встречаются варианты написания с буквой «а» — Шаботнева, но это, скорее всего, результат акающего произношения, когда безударное «е» звучит как «а», и на письме отражается неверно. Исконная форма — через «е».

В целом, носительница фамилии Шеботнева может быть уверена: её предок был человеком деятельным, не сидел сложа руки, за что и получил прозвище, ставшее родовым именем.