Фамилия Шефец — редкая и во многом загадочная. Её главная особенность — суффикс -ец, который в русской ономастике обычно указывает на происхождение человека из определённой местности (ср. донец — с Дона, томич — из Томска, но здесь модель другая). В фамилии Шефец этот суффикс, скорее всего, не топонимический, а прозвищный или профессиональный: он мог означать «человек, связанный с тем, что названо корнем».

Корень шеф- сразу отсылает к заимствованному слову «шеф» (начальник, глава), которое пришло в русский язык из французского chef в XVIII–XIX веках. Если фамилия образовалась в этот период, то носитель мог быть прозван Шефом за властный характер, должность или даже за то, что служил у кого-то «шефом» (например, в военном или гражданском ведомстве). Однако есть и более ранняя версия: корень мог восходить к немецкому Schäfer (пастух) или Schiff (корабль), переделанному на русский лад. В таком случае Шефец — это «пастушок» или «корабельщик», но это менее вероятно, так как в русских говорах форма «шеф» в значении «пастух» не зафиксирована.

Спорный момент — ударение. Если оно падает на первый слог (Ше́фец), то фамилия могла образоваться от прозвища Шеф с уменьшительным суффиксом -ец (как «братец»). Если на последний (Шефе́ц), то перед нами типичная западноукраинская или польская модель, где -ец — аналог русского -ов, то есть «сын Шефа». В этом случае фамилия могла возникнуть на территории бывшей Галиции или Волыни, где такие формы (Петрец, Иванец) встречаются часто.

Географически фамилия Шефец встречается единично, преимущественно в южных и западных регионах бывшей Российской империи, а также среди еврейских семей (где «шеф» могло быть идишизированной формой немецкого Schäfer или Scheffel — мера сыпучих тел). Точных данных о сословной принадлежности нет: это мог быть как мещанин, так и крестьянин, получивший фамилию по прозвищу начальника или по профессии, переосмысленной через заимствованное слово.