Фамилия Шеклеин — редкая, с неочевидной этимологией, и здесь нужно разбираться по частям, а не гадать на кофейной гуще.

Основа фамилии — Шекле-, к которой добавлен типичный русский суффикс принадлежности -ин. Суффикс -ин указывает на то, что фамилия образована от имени или прозвища, оканчивающегося на -а или -я (Шекля, Шеклей). Вопрос в том, что стояло за этим прозвищем.

Первая и самая вероятная версия — профессиональная. В русских говорах, особенно в центральных и южных регионах, «шекла» могла означать мелкую щепу, стружку, отходы при обработке дерева. Шеклеем могли прозвать плотника, столяра или того, кто занимался расщеплением дерева на лучину или дранку. Фамилия Шеклеин в таком случае — «сын плотника-шеклая». Подтверждение этой версии — наличие однокоренных фамилий Шекланов, Шеклов, которые тоже связывают с деревообработкой.

Вторая версия — от личного имени Шекля, которое могло быть народной формой крестильного имени, например, Евсевий или Алексий (через усечение и переосмысление). Но это менее надёжно: прямых параллелей в святцах или документах XVI–XVII веков для такой формы нет.

Третья, более спорная гипотеза — тюркская. В тюркских языках есть слово «шекле» (с ударением на последний слог) — «форма», «образ», «вид». Однако в таком значении оно не образует русскую фамилию с суффиксом -ин, а скорее дало бы Шеклеев. Поэтому эта версия маловероятна.

Географически фамилия Шеклеин тяготеет к центральной России, особенно к Владимирской, Нижегородской и Костромской областям — регионам, где исторически было развито плотницкое и лесное ремесло. Встречается она и в Сибири, куда могла быть занесена переселенцами в XIX — начале XX века.

Итак, с высокой долей вероятности предки Шеклеиных были людьми, работавшими с деревом: не обязательно мастерами-краснодеревщиками, а скорее теми, кто занимался черновой обработкой древесины, щепным промыслом. Фамилия закрепилась за родом, и прозвище, данное по ремеслу, стало наследственным.