Фамилия Шеманаев образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Шеманаев образована от прозвища Шеманай, которое, вероятно, восходит к диалектному названию рыбы шемая — шемань. Шемая — это род рыб семейства карповых. Проходная шемая, прежде всего азово-черноморская, служила в водах России важным объектом промысла и ценилась очень высоко. За нежное вкусное жирное мясо в Персии этот вид называется «шах-маге»(«царская рыба»), откуда и произошло её русское название — шемая. Численность шемаи сильно сократилась в результате перелова. В настоящий момент они разводятся в питомниках. Согласно этому, можно предположить, что прозвище Шеманай мог получить рыболов или торговец рыбой. Согласно другой версии, прозвище Шеманай восходит к названию небольшой сибирской речки Шеманки. В таком случае можно предположить, что основатель рода Шеманаевых жил недалеко от этой реки. Не исключена связь фамилии Шеманаев с названием города Шуманай, расположенного в юго-западной части Каракалпакии (автономная республика в составе Узбекистана). Возможно, предок человека по фамилии Шеманаев был выходцем из этого города. Чередование е/у связано с изменениями, происходившими при преобразовании прозвища в фамилию. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шеманай, со временем получил фамилию Шеманаев. О точном месте и времени возникновения фамилии Шеманаев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шеманаев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.