Фамилия Шемяткова — женская форма фамилии Шемятков, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или мирским именем Шемятка. Чтобы понять корень, полезно разобрать слово по составу: основа «шемятк-» и суффикс «-ов», который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей сын?» — сын Шемятки). Само прозвище Шемятка, скорее всего, образовано от глагола «шемятить» или «шемять» — в северных и центральных говорах это означало «мять, тискать, комкать». В словаре Владимира Даля «шемякать» — говорить невнятно, «шемяга» — оборванец или плохая одежда. Таким образом, прозвище могло относиться к человеку с небрежной речью, неопрятным внешним видом либо к тому, кто постоянно что-то мнёт или торгует подержанным товаром.

Суффикс «-к-» в основе уменьшительно-уничижительный, что типично для русских прозвищ XV–XVII веков: так могли называть невысокого или суетливого человека. Интересно, что в псковских и новгородских говорах «шемята» — также название мелкой рыбы (ерша или пескаря), что добавляет ещё одну версию: прозвище могло перейти на рыбака или человека с мелкой, «ершистой» внешностью. Фамилия Шемятков фиксируется в переписях преимущественно в Вологодской и Архангельской губерниях — это подтверждает северное происхождение, где диалектные слова сохранялись дольше.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Шемякин, Шемяков, Шемягин — все они восходят к тем же корням, но с разными суффиксами. Шемятков — более редкая форма, с уменьшительным суффиксом, что делает её «младшей» в словообразовательном ряду. Встречается также вариант Шемяткин (с суффиксом «-ин»), что указывает на то же прозвище, но в другой модели наследования. Если Шемяков мог принадлежать боярскому роду (вспомним князя Дмитрия Шемяку XV века), то Шемятков — фамилия крестьянская или посадская, без аристократического следа.

В целом, носительница фамилии Шемяткова может с высокой вероятностью считать своими предками людей из северных регионов России, возможно, связанных с рыболовством или мелкой торговлей, а само прозвище, лёгшее в основу, было дано за какую-то характерную черту — манеру речи, внешний вид или поведение.