Фамилия Шепаткова принадлежит к распространённому типу русских фамилий с суффиксом -ов/-ев, но её основа неочевидна. Сразу скажем: перед нами не отчество от крестильного имени, а прозвище, связанное с диалектной лексикой.

В основе фамилии лежит слово «шепат» или «шепатый». В русских говорах, особенно северных и вологодских, «шепать» означало «драть, щипать, отщеплять», а «шепа» — это щепка, лучина или заноза. Человек по прозвищу Шепат — тот, кто занимался щепным товаром: колол лучину, делал дранку для крыш, щепу для плетения корзин. В просторечии так могли назвать и сухощавого, «щепетильного» человека, похожего на щепку, или того, кто постоянно «шепал» — ворчал, придирался, донимал мелочами.

Суффикс -ов образует притяжательную форму: Шепатков — «сын Шепата». Женская форма Шепаткова — это либо жена, либо дочь Шепаткова. Фамилия встречается довольно редко, её ареал тяготеет к Вологодской, Архангельской и Кировской областям — как раз там, где промысел по заготовке щепы и лучины был распространён до XX века.

Любопытно, что в некоторых говорах «шепат» означал не только щепку, но и «сплетника, переносчика слухов». Это добавляет фамилии ещё один смысловой слой: предок мог быть не ремесленником, а человеком с острым языком. Однозначно выбрать версию трудно, но связь с щепой и лучинным промыслом кажется более правдоподобной — такие прозвища давали по занятию, а не по характеру.

Фамилия не получила широкого распространения, не попала в дворянские родословные и не обросла известными носителями. Это типичная фамилия крестьянского или посадского сословия: её носили люди, чьи предки жили в лесной полосе России и кормились тем, что давал лес.