Фамилия Шепега — редкий и выразительный пример того, как в основе русской фамилии может лежать не имя, а яркая физическая или речевая особенность человека. В отличие от распространённых Шепелёвых, которые образованы от слова «шепелявый» через суффикс -ев, Шепега сохранила более архаичную и прямую форму прозвища. Разница в суффиксе здесь ключевая: -ега или -ага часто встречается в северных и сибирских говорах, придавая слову оттенок грубоватой, бытовой характеристики (сравните: бродяга, работяга, бедняга). Соответственно, Шепега — это человек, который шепелявит, то есть картавит или не выговаривает свистящие и шипящие звуки.

Вероятнее всего, прозвище Шепега закрепилось за предком в XVI–XVII веках, когда на Руси активно формировались фамилии от личных прозвищ. Такая фамилия могла возникнуть в среде крестьян или посадских людей, где прозвище давалось по самому заметному признаку — и не обязательно с насмешкой, а скорее для точного опознания человека в общине. Суффикс -ега указывает на то, что фамилия могла сложиться на территории, где говорили на окающих говорах (север и северо-восток), хотя сейчас носители Шепеги встречаются по всей России.

В ономастических справочниках, например в работах Б. Унбегауна, фамилии, образованные от дефектов речи, рассматриваются как типичные для русской антропонимии: Гугнявый, Заика, Шепель. Шепега стоит в этом ряду, но выделяется тем, что не получила массового распространения — в отличие от Шепелёва, который стал одной из частых фамилий. Это делает Шепегу более локальной и, возможно, связанной с конкретным родом, а не с целым сословием. Интересно, что в украинском языке слово «шепега» тоже означает шепелявого, но с другим оттенком — там оно может относиться к человеку, который не выговаривает «с» и «ш», путая их.

Таким образом, носитель фамилии Шепега может считать своим предком человека с характерной речевой манерой, жившего в северных или центральных регионах России. Фамилия не указывает на дворянское происхождение или ремесло — она говорит о том, что в основе лежит живое, бытовое прозвище, которое закрепилось в документах и передалось потомкам.