Фамилия Шептифрац — редчайший случай в русском ономастиконе, и её происхождение не укладывается в привычные схемы. С первого взгляда она кажется иноязычной, но при детальном разборе обнаруживает черты, характерные для искусственных или книжных фамилий, возникших в среде духовенства.

Словообразовательная модель здесь необычна. Окончание «-ц» не свойственно русским фамилиям — оно скорее указывает на польское или украинское влияние, где суффикс «-ец» часто давал фамилии вроде Ковалец, Морозец. Однако основа «Шептифра» не имеет очевидных славянских корней. Это наводит на мысль, что фамилия могла возникнуть как переосмысление или искажение немецкой фамилии (например, от Schäfter или Schäfer — пастух, овчар) с добавлением славянского патронимического суффикса. В таком случае «Шептифрац» — это «сын Шептифра», где вторая часть со временем утратила первоначальный смысл.

Более правдоподобная версия связывает фамилию с семинарской традицией. В XVIII–XIX веках в духовных училищах России будущим священникам нередко давали фамилии, образованные от латинских или греческих слов, часто с игривым или нарочито сложным звучанием. «Шептифрац» может быть калькой с латинского «septifragus» — «семиразрушитель» (от septem — семь и frangere — ломать, разрушать). В таком случае фамилия носила символический или шуточный характер, возможно, связанный с библейскими аллюзиями (семь смертных грехов, семь печатей). Подобные «учёные» фамилии встречаются у выпускников Киевской и Московской духовных академий.

Географически фамилия почти не встречается за пределами бывшей Российской империи. В современных базах данных носители Шептифрац фиксируются единично — в основном на Украине и в южных регионах России. Это подтверждает гипотезу о книжном, а не крестьянском происхождении: такие фамилии редко уходили в народ и оставались в узких сословных группах.

Итак, предок носителя фамилии Шептифрац, скорее всего, был человеком, получившим её в семинарии — либо как переделку иностранной фамилии, либо как искусственное образование от латинского корня. Никаких известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что делает её ещё более уникальной и трудной для однозначной трактовки.