Фамилия Шептушкина образована от прозвища Шептушка. В основе — глагол «шептать», но значение прозвища могло быть разным. Самый прямой вариант: так называли человека, который говорил тихо, шепотом, или любил пошептаться, посплетничать. Однако в русских говорах у слова «шептун» и его производных были и другие смыслы. В некоторых регионах «шептуном» называли знахаря, заговаривающего болезни, — человека, который лечил шепотом, нашептывал заговоры. Прозвище Шептушка мог получить как тихоня, так и деревенский лекарь.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий. Основа — «шептушк-», суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Шептушкин, то есть сын или потомок Шептушки. Окончание «-а» в женском варианте фамилии — грамматическое, для замужних и незамужних женщин. Мужской вариант — Шептушкин. Фамилия образована по патронимическому принципу, распространенному в центральных и северных губерниях России.

Интересная деталь: в русских фамилиях на «-ушкин» часто сохраняется уменьшительно-ласкательный оттенок прозвища. Шептушка — это не просто «шептун», а скорее «шептунчик», что могло указывать на молодого человека или на незлобивый, безобидный характер носителя прозвища. Сравните с фамилиями Воробушкин, Голубушкин — там суффикс смягчает характеристику.

Встречаемость фамилии Шептушкина невысокая, она редкая. Географически чаще фиксируется в Поволжье и некоторых областях центральной России. В дореволюционных источниках носители фамилии относятся в основном к крестьянскому сословию, что типично для фамилий такого типа. Прозвища, образованные от особенностей речи или поведения, давали в деревне метко и на века.