Фамилия Шептяну — редкий случай в русском ономастиконе, и её разговор стоит начать не с корня, а с суффикса. Окончание -у выдает в ней молдавское или румынское происхождение: по модели образования это типичная фамилия из тех мест, где к основе добавляли суффикс -ану/-яну, указывающий на принадлежность к роду или местности. В русской среде такие фамилии почти не встречаются, и Шептяну — скорее всего, румынизированная форма.

Основа Шепт- восходит к глаголу «а шопти» — шептать, говорить тихо. В румынском языке «шоптя» (șopti) означает «шептать», а «шоптяну» дословно переводится как «шептун» или «тот, кто шепчет». Прозвище могли дать человеку с тихим голосом, склонному к тайным разговорам или, напротив, тому, кто разносил слухи шёпотом. В восточнороманской антропонимии такие прозвища не редкость: они описывали поведение или манеру речи, а не профессию.

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с топонимом. В Румынии и Молдавии встречаются сёла с корнем Шепт- (например, Шептеличь), и фамилия могла образоваться от названия места, откуда родом предок. Но в таком случае ожидалась бы форма Шептяну с ударением на первый слог, а не на последний, как чаще бывает в прозвищных фамилиях.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шепте, Шептицкий, Шептун — показывает, что в русском контексте корень связан с тем же шептанием, но суффиксы другие. Шептяну стоит особняком: это не адаптированная к русскому языку форма, а прямая калька с румынского, сохранившая артикль -у. Носители такой фамилии — потомки переселенцев из Бессарабии или Молдавского княжества, которые попали в Российскую империю в XIX веке, возможно, после присоединения Бессарабии в 1812 году.

В словарях русских фамилий Шептяну не фигурирует: это говорит о её узкой региональной привязке. Встретить её можно в основном на юге России, в Приднестровье и в диаспоре. Социальный контекст — скорее всего, крестьяне или мещане, без дворянских корней, так как румынская знать использовала другие модели фамилий (с суффиксами -еску или -иу).