Фамилия Шепурова — женская форма фамилии Шепуров, и её происхождение стоит искать через мужской вариант. Основа фамилии — «шепур», слово, которое в русских говорах имело несколько значений. Самое вероятное: в архангельских и вологодских диалектах «шепур» — это сор, мусор, мелкая дрянь, а также неопрятный человек. Прозвище Шепур могли дать неряхе или тому, кто занимался уборкой, вывозом мусора, — в старину прозвища часто давались по занятию или по внешнему виду без оценочного оттенка, скорее как констатация факта.

Вторая версия, менее распространённая, связывает «шепур» с глаголом «шептать»: в некоторых говорах так называли шептуна, колдуна или знахаря, который лечил заговорами. Это тоже возможный источник прозвища, особенно в северных регионах, где вера в знахарей была сильна. Но первая версия — с мусором и неопрятностью — встречается в диалектных словарях чаще и выглядит надёжнее.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Шепуров — это «сын Шепура» или «из рода Шепура». Фамилия недворянская, скорее крестьянская или мещанская, что подтверждается её отсутствием в родословных книгах знати. Встречается она преимущественно на Русском Севере: в Архангельской, Вологодской областях, а также в Кировской — там, где диалектное слово «шепур» было в ходу.

Стоит отметить, что фамилия редкая. В дореволюционных переписях она не фигурирует массово, что говорит о локальном происхождении — вероятно, от одного прозвища в небольшой деревне или волости. Однокоренные фамилии — Шепурин, Шепурнов, Шепуровский — встречаются ещё реже, и все они восходят к той же основе.