Фамилия Шерлыгин образована от прозвища Шерлыга. Скорее всего, оно происходит от слова «шерл», которое имеет значение «ценный камень, черный турмалин». Вполне возможно, что прозвище Шерлыга мог получить купец, зажиточный человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шерлыга, со временем получил фамилию Шерлыгин.